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ASIGNATURA OPTATIVA
NIVEL MAESTRÍA
ÁREA: Bioquímica y Química Bioorgánica


QUÍMICA COMPUTACIONAL

Clasificación: Optativa Seriación: Ninguna
Total de Horas: Horas Teóricas: Horas Prácticas: Créditos:
60 45 15 7
Objetivo General:
Utilizar las herramientas informáticas en el estudio de la estructura tridimensional de las moléculas que le permitan predecir sus propiedades físico-químicas para la resolución de situaciones concretas.
Contenido temático
  1. Modelos Moleculares I
  2. Introducción a los conceptos básicos
    La Mecánica Clásica
    Parametrización de los campos de fuerzas y la mecánica molecular
    Ejemplos de aplicaciones
  3. Modelos Moleculares II
  4. La ecuación de Schrodinger
    La aproximación de Born-Oppenheimer y la aproximación adiabática
    La aproximación de Hartree y Hartree Fock
    Las ecuaciones de Hartree-Fock-Rothaan
    Teoría del Funcional de la Densidad
    Base de Expansión
    Los Métodos Semiempiricos
    Ejemplos de Aplicaciones
  5. Técnicas de Simulación
  6. Optimización Geométrica
    Minimización Energética
    Exploración del espacio conformacional
    Dinámica Molecular
  7. Aplicaciones
  8. Basicidad y Acidez
    Periodicidad y estructura de bandas
    Establecimiento de relaciones estructura actividad
    Diseño de Fármacos asistidos por computadora
Estrategias de enseñanza-aprendizaje:
Exposición con discusión dirigida Trabajo en pequeños grupos. Asesoría individual. Asesoría grupal. Resolución de problemas. Simulaciones computacionales.
Criterios de evaluación:
• Pruebas escritas: 30 %
• Informe del laboratorio de
• Análisis de problemas: 15 %
química computacional: 20 %
• Seminarios: 20 %
• Tareas escritas: 15 %
Perfil profesiográfico requerido:
Maestro o Doctor en Ciencias con experiencia en el área
Bibliografía:
  1. I.N. Levine, Quantum Chemistry, Ed. Prentice Hall, 5ta. Edición 2001.
  2. M. Springborg, Methods of electronic-Structure Calculations: from molecules to solids, Ed. Wiley, 2000.
  3. J.C. Christopher, Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, Ed. John Wiley & Sons, 2005.
  4. Y. David, Computational Chemistry: A Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems, Ed. Wiley-IEEE, 2004.
  5. D.A. McQuarrie and J.D. Simon, Physical Chemistry: A molecular approach,     University Science books, 1997. 
  6. P.A. Cox, The electronic structure and Chemistry of solids, oxford Science publications, 1997.